Disminución del RNA de SARS-CoV-2 en matrices acuáticas ambientales
SPA_pdf
ENG_pdf (English)

Palabras clave

SARS-CoV-2
coronavirus
Carga viral
Vigilancia genomica
Ambiente

Métricas de PLUMX 

Resumen

SARS-CoV-2 está presente en las heces y saliva de individuos con infecciones sintomáticas y asintomáticas, estos fluidos se depositan en frecuentemente en aguas residuales, por lo tanto, la vigilancia del ARN de SARS-CoV-2 presente en estas matrices acuáticas es una herramienta prometedora como una señal de alerta temprana para detectar futuras pandemias. En la actualidad se sabe que el material genético del virus puede sobrevivir por varios días en agua residual, sin embargo, más información es necesaria para entender mejor la cinética de la carga viral en matrices acuáticas a través del tiempo. El objetivo de este trabajo fue determinar la cinética de detección de ARN de SARS-CoV-2 a través del tiempo en diferentes matrices acuáticas. Cada una de las matrices acuáticas (Marina, influente, efluente y potable) fue inoculada y evaluada por 62 días para determinar la cinética de decaimiento en la detección de ARN viral por RT-PCR en tiempo real. El ARN de SARS-CoV-2 fue detectado durante la duración del experimento en todas las matrices. El agua de efluente, influente y marina dificultaron la detección de SARS-CoV-2 conforme avanzaba el tiempo con una vida media de 15.24, 43.24, y 32.38 días y T90 de 50.63, 143.64 y 107.54 días respectivamente. Por otra parte, en el agua potable, la detección fue constante a lo largo del experimento. Este estudio demuestra el impacto de la matriz acuática en la detección de la carga viral probablemente afectada por los parámetros fisicoquímicos, de igual forma, es interesante entender que el SARS-CoV-2 puede detectarse por un largo periodo de tiempo en aguas recreativas y residuales lo que lo vuelve una herramienta relevante para realizar epidemiología basada en agua como un indicator de la salud de la comunidad.

https://doi.org/10.15741/revbio.10.e1529
SPA_pdf
ENG_pdf (English)

Citas

Aguiar-Oliveira, M.L., Campos, A., Matos, A.R., Rigotto, C., Sotero-Martins, A., Teixeira, P., & Siqueira, M.M. (2020). Wastewater-based epidemiology (WBE) and viral detection in polluted surface water: A valuable tool for COVID-19 surveillance-A brief review. International Journal of Environmental Research Public Health 2020, 17(24), 9251.https://doi:10.3390/ijerph17249251.

Ahmed, W., Bertsch, P.M., Bibby, K., Haramoto, E., Hewitt, J., Huygens, F., Gyawali, P., Korajkic, A., Ridell, S., Sherchan, S.P., Simpson, S.L., Sirikanchana, K., Symonds, E.M., Verhagen, R., Vasan, S.S., Kitajima, M., & Bivins, A. (2020). Decay of SARS-CoV-2 and surrogate murine hepatitis virus RNA in untreated wastewater to inform application in wastewater-based epidemiology. Environmental Research, 191,110092. https://doi.org/10.1016/j.envres.2020.110092

Basavaraju, S., Aswathanarayan, J.B., Basavegowda, M., & Somanathan, B. (2021). Coronavirus: Occurrence, surveillance and persistence in wastewater. Environmental Monitoring and Assessment, 193,508. https://doi.org/10.1007/s10661-021-09303-8

Bivins, A., Greaves, J., Fischer, R., Yinda, K. C., Ahmed, W., Kitajima, M., Munster, V.J., & Bibby, K. (2020). Persistence of SARS-CoV-2 in Water and Wastewater. Environmental Science & Technology Letters, 7(12), 937-942. https:// doi: 10.1021/acs.estlett.0c00730

Chia, P. Y., Coleman, K. K., Tan, Y. K., Ong, S. W. X., Gum, M., Lau, S. K., Lim X.F., Lim A.S., Sutjipto, S., Lee, P.H., Son, T.T., Young, B.E., Milton, D.K., Gray, G.C., Schuster, S., Barkham, T., De, P.P., Vasoo, S., Chan, M., Peng Ang, B.S., & Marimuthu, K.. (2020). Detection of air and surface contamination by SARS-CoV-2 in hospital rooms of infected patients. Nature Communications, 11(1), 2800. https://doi: 10.1038/s41467-020-16670-2

De Rijcke, M., Shaikh, H.M., Mees, J., Nauwynck, H., & Vandegehuchte, M.B. (2021). Environmental stability of porcine respiratory coronavirus in aquatic environments. Plos One, 16(7): e0254540. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0254540

Fukuta, M., Mao, Z. Q., Morita, K., & Moi, M. L. (2021). Stability and Infectivity of SARS-CoV-2 and Viral RNA in Water, Commercial Beverages, and Bodily Fluids. Frontiers in Microbiology, 12. https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.667956

Gerrity, D., Papp, K., Stoker, M., Sims, A., & Frehner, W. (2021). Early-pandemic wastewater surveyllance of SARS-CoV-2 in Southern Nevada: Methodology, occurrence and incidence/prevalence considerations. Water Research X, 10,100086. https://doi.org/10.1016/j.wroa.2020.100086

Giraud-Billoud, M., Cuervo, P., Altamirano J.C., Pizarro, M., Aranibar, J.N., Catapano, A., Cuello, H., Masachessi G., & Vega, I.A. (2021). Monitoring SARS-CoV-2 RNA in wastewater as an epidemiological tool in Mendoza, Argentina. Science of the Total Environment, 796,148887. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.148887

Grant, M. C., Geoghegan, L., Arbyn, M., Mohammed, Z., McGuinness, L., Clarke, E. L., & Wade, R. G. (2020). The prevalence of symptoms in 24,410 adults infected by the novel coronavirus (SARS-CoV-2; COVID-19): A systematic review and meta-analysis of 148 studies from 9 countries. PLoS One, 15(6), e0234765. https://doi: 10.1371/journal.pone.0234765

Haramoto, E., Malla, B., Thakali, O., & Kitajima, M. (2020). First environmental surveillance for the presence of SARS-CoV-2 RNA in wastewater and river water in Japan. Science of The Total Environment, 737, 140405. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140405

Kim, J.M., Kim, H.M., Lee, E.J., Jo, H.J., Yoon, Y., Lee, N.J., Son, J., Lee, Y.J., Kim, M.S., Lee, Y.P., Chae, S.J., Park, K.R., Cho, S.R., Park, S., Kim, S.J., Wang, E., Woo, S., Lim, A., Park, S.J., & Jang, J. (2020). Detection and isolation of SARS-CoV-2 in serum, urine and stool specimens of COVID-19 patients from the republic of Korea. Osong Public Health and Research Perspectives, 11(3),112-117. https://doi.org/10.24171/j.phrp.2020.11.3.02

Kitajima, M., Ahmed, W., Bibby K., Carducci, A., Gerba, C.P., Hamilton K.A., Haramoto, E., & Rose, J.B. (2020). SARS-CoV-2 in wastewater: State of the knowledge and research needs. Science of the Total Environment, 739, 139076. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139076

Kumar, M., Kumar Patel, A., Shah, A.V., Raval, J., Rajpara, N., Joshi, M., & Joshi C. (2020). First proof of the capability of wastewater surveillance for COVID-19 in India through detection of genetic material of SARS-CoV-2. Science of the Total Environment, 746,141326. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.141326

Lednicky, J. A., Lauzardo, M., Fan, Z. H., Jutla, A., Tilly, T. B., Gangwar, M., Uzmani, M., Shankar, S., Mohamed, K., Eirguen-Fernandez, A., Stephenson, C.J., Alam., M., Elbadry, E., Loeb, J, Subramanian, K., Waltzek, T., Cherabuddi, Morris Jr, G., & Wu, C.-Y. (2020). Viable SARS-CoV-2 in the air of a hospital room with COVID-19 patients. International Journal of Infectious Diseases, 100, 476-482. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.09.025

Li, G., Fan, Y., Lai, Y., Han, T., Li, Z., Zhou, P., Wang, P.P, Hu, D., Liu, X., Zhang, Q., & Wu, J. (2020). Coronavirus infections and immune responses. Journal of Medical Virology, 92(4), 424-432. https://doi: 10.1002/jmv.25685

Liotti, F. M., Menchinelli, G., Marchetti, S., Morandotti, G. A., Sanguinetti, M., Posteraro, B., & Cattani, P. (2021). Evaluation of three commercial assays for SARS-CoV-2 molecular detection in upper respiratory tract samples. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 40(2), 269-277. https://doi: 10.1007/s10096-020-04025-0

Mitic, V., Lazovic, G., Milosevic, D., Ristanovic, E., Simeunovic, D., Tsay, C., Milosevic, M., & Vlahovic, C. (2021). Brownian fractal nature coronavirus motion. Modern Physics Letters B, 35 (4), 2150076. https://doi.org/10.1142/S0217984921500767

Mordecai, G.J., & Hewson, I. (2020). Coronaviruses in the sea. Frontiers in Microbiology, 11,1975. https://doi: 10.3389/fmicb.2020.01795

Pasquarella, C., Colucci, M. E., Bizzarro, A., Veronesi, L., Affanni, P., Meschi, T., Brianti,E., Vitali, P., & Albertini, R. (2020). Detection of SARS-CoV-2 on hospital surfaces. Acta bio-medica: Atenei Parmensis, 91(9-S), 76-78. https://doi: 10.23750/abm.v91i9-S.10137

Polo, D., Quintela-Baluja, M., Corbishley, A., Jones, D.L., Singer, A.C., Graham, D.W., & Romalde, J.L. (2020). Making waves: Wastewater-based epidemiology for COVID-19-approaches and challenges for surveillance and prediction. Water Research, 186,116404. https://doi.org/10.1016/j.watres.2020.116404

Randazzo, W., Truchado, P., Cuevas-Ferrando, E., Simón, P., Allende, & Sánchez, A. (2020). SARS-CoV-2 RNA in wastewater anticipated COVID-19occurrence in a low prevalence area. Water Research, 181,115942. https://doi.org/10.1016/j.watres.2020.115942

Razzini, K., Castrica, M., Menchetti, L., Maggi, L., Negroni, L., Orfeo, N. V., Pizziccheri, A., Stocco, M., Muttini, S., & Balzaretti, C. M. (2020). SARS-CoV-2 RNA detection in the air and on surfaces in the COVID-19 ward of a hospital in Milan, Italy. Science of The Total Environment, 742, 140540. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140540

Rimoldi, S. G., Stefani, F., Gigantiello, A., Polesello, S., Comandatore, F., Mileto, D., Maresca, M., Longobardi, C., Mancon, A., Romeri, F., Pagani, C., Cappelli, F., Roscioli, C., Moja, L., Gismondo, M. R., & Salerno, F. (2020). Presence and infectivity of SARS-CoV-2 virus in wastewaters and rivers. Science of The Total Environment, 744, 140911. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140911

Sala-Comorera, L., Reynolds, L.J., Martin, N.A., O´Sullivan, J.J., Meijer W.G., & Fletcher N.F. (2021). Decay of infectious SARS-CoV-2 and surrogates in aquatic environments. Water Research, 201,117090. https://doi.org/10.1016/j.watres.2021.117090

Sherchan, S.P., Shahin, S., Ward, L.M., Tandukar, S., Aw, T.G., Schmitz, B., Ahmed, W., & Kitajima, M. (2020). First detection of SARS-CoV-2 RNA in wastewater in North America: Astudy in Louisiana, USA. Science of the Total Environment, 743,140621. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.140621

Thompson, J.R., Nancharaiah, Y.V., Gu, X., Lin Lee, W., Rajal, V.B., Haines, M.B., Girones, R., Ching N. L., Alm, E.J., & Wuertz, S. (2020). Making waves: Wastewater surveillance of SARS-CoV-2 for population-based health management. Water Research, 184,116181. https://doi.org/10.1016/j.watres.2020.116181

World Health Organization (2020a). Novel Coronavirus (2019-nCoV): situation report, 1. Geneva: World Health Organization.

World Health Organization (2020b). Novel Coronavirus (2019-nCoV): situation report, 22. Geneva: World Health Organization.

World Health Organization (2021). Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern.

World Health Organization (2022). WHO Coronavirus (COVID-19) dashboard. https://covid19.who.int. Accession date: January 25th 2023

Zhou, J., Otter, J. A., Price, J. R., Cimpeanu, C., Meno, D., Kinross, J., Boshier, P.R., Mason, S., Bolt, F.,Holmes, A.H., & Barclay,W. S. (2020). Investigating Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Surface and Air Contamination in an Acute Healthcare Setting During the Peak ofthe Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Pandemic in London. Clinical Infectious Diseases, 73(7), e1870-e1877. https://doi: 10.1093/cid/ciaa905

Licencia Creative Commons
Revista Bio Ciencias por Universidad Autónoma de Nayarit se encuentra bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Unported.
Basada en una obra en http://biociencias.uan.edu.mx/.
Permisos que vayan más allá de lo cubierto por esta licencia pueden encontrarse en http://editorial.uan.edu.mx/index.php/BIOCIENCIAS.licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional